Ursache für den "verschwundenen" Grub ist schwer zu sagen. Hast du auf WIndows-
Seite evtl. eine Software aktiv, die den MasterBootRecord(MBR) o.ä. "überwacht"?
Grub kannst du reinstallieren, siehe hier im Wiki den Beitrag zu Grub.
Dann halt ausprobieren, ob sich das reproduzieren läßt.
Da dein System ja scheinbar noapic als Parameter braucht, mußt du das bei jedem
CD-Boot bzw. später permanent in der /boot/grub/menu.lst als Kernelparameter
eintragen.
APIC kümmert sich um eine erweiterte Verwaltung der Hardware-IRQs, es ist kein
Beinbruch das nicht zu nutzen. Deutet lediglich auf ein etwas "unsauberes" System bzw.
Hardware hin, oder auf softwareseitige Probleme des Kernels (nutzt du das aktuelle
ISO-Image zum Installieren?).
Siehe z.B.:
http://de.wikipedia.org/wiki/APIC