Ich kenne mich jetzt noch niht so super aus mit linux aber könntest du dir nicht einfach ein scrpt schreiben, das beim booten gestartet wird und dich fragt welche config du nutzen möchtest? in etwa so:
Welche config möchtest du verwenden:
1: win
2: laptop
if (1)
{
mv xorg.conf.twin xorg.conf
}
if (2)
{
mv xorg.conf.laptop xorg.conf
}
ist natürlich keine korrekte syntax nur pseudocode aber mit perl müsste das doch gehen...
gruß bliss