Avidemux ist ein kleiner Video-Editor, den ich noch aus Windows-Zeiten kenne. Wenn ich damit ein mp4-Video öffne, dann sehe ich nur eine Art Flackern oder das Programm stürzt gänzlich ab. Hat jemand Ähnliches schon erlebt? Wie würde die Lösung aussehen?

Nutzt Du Avidemux unter Wayland ?

Da Avidemux und Wayland sich nicht mögen wegen Qt6 starte ich es so:
avidemux3_qt5 --platform 'xcb'

und es funktioniert 1a vielleicht hilft es Dir ja auch.

Tipp: Falls du nur glatte Schnitte brauchst empfehle ich v2cut wenn nur Anfang und Ende von einem Video gesetzt werden muss, bzw. vcut wenn ein Video viele Schnitte braucht.
https://codeberg.org/tuxnix/vcut-v2cut