Du musst deine aktuell installierten Programme als Standard festlegen:
https://wiki.archlinux.org/index.php/Default_Applications
Bei Arch ist die MIME-Zuordnung in Gnome normalerweise vollkommen zufällig, weil da noch kein Standard entwickelt wurde:
http://www.freedesktop.org/wiki/Specifications/mime-actions-spec
Andere Distributionen liefern eine defaults.list mit, in der alle vorinstallierten Programme verankert sind.