pacman -Ql | grep /etc/rc.d
pacman -Ql | grep /etc/init.d
sollte einen Anhalt bieten. Die gefundenen Pakete reinstallieren oder ggf. besser nur die gelöschten /etc/rc.d/* Dateien aus den Paketen holen.
Das mußt du ggf. mittels externer Boot-CD und chroot machen (->Wikis).
Wäre ein gelegentlches (bzw. reguläres) Sichern von /etc nicht einfacher gewesen?? (Ja, ich weiß,… <g>)