schreib dir ein kleines skript mit folgendem Inhalt:
#!/bin/bash
cd /pfad/zum/verzeichnis/arduino
./arduino
und speichere es in deinem home Verzeichnis z. Bsp. als start-arduino.sh, dann mach es noch ausführbar:
$ chmod u+x ~/start-arduino.sh
und trage dieses Skript in den Starter ein, also bei Befehl: /home/deinbenutzername/start-arduino.sh