Wenn sie automatisiert zuzuordnen wären, hatte fsck das gemacht, und sie nicht nach l+f verschoben.
Ich denke dir bleibt nichts weiter übrig, als sie anzugucken und dann zu entscheiden was damit passiert. file könnte dabei sehr hilfreich sein:
# file unbekannte-datei
unbekannte-datei: PDF document, version 1.4