Standardmäßig werden Programme in /home/benutzername/.wine/drive_c/Programme/ installiert, sofern nicht anders angegben. Aufrufen kannst du die entweder über die Menüeinträge, wenn welche angelegt werden oder du startest sie über die Konsole mittels
wine /home/benutzername/.wine/drive_c/Programme/Programmname/Program.exe
Du kannst natürlich auch per Dateimanager in den gennanten Ordner gehen und durch Rechtsklick-->Öffnen mit "Wine" auf die programm.exe das Programm starten.